Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL12Q53G59 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL12Q53G59 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms