Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ODF1Q14990 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms