Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD4Q13485 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD4Q13485 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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