Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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ERCC8Q13216 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ERCC8Q13216 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ERCC8Q13216 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ERCC8Q13216 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ERCC8Q13216 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ERCC8Q13216 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ERCC8Q13216 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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