Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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NR1H3Q13133 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
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NR1H3Q13133 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1H3Q13133 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1H3Q13133 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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