Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 ERG11YHR007C 1593 nt3.08□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 CCT7YJL111W 1653 nt3.08□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 UTP14YML093W 2700 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 PMR1YGL167C 2853 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YIL169CYIL169C 2988 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YER158W-AYER158W-A 216 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 ATG27YJL178C 816 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 PAI3YMR174C 207 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 RRT16YNL105W 429 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 ATP20YPR020W 348 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 CBP6YBR120C 489 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 snR43snR43 209 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 APC2YLR127C 2562 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 SLF1YDR515W 1344 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 ESC2YDR363W 1371 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 URK1YNR012W 1506 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 PCK1YKR097W 1650 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 ATG13YPR185W 2217 nt3.07□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 GCV2YMR189W 3105 nt3.06□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YBT1YLL048C 4986 nt3.06□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YCR013CYCR013C 648 nt3.06□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 RIM1YCR028C-A 408 nt3.06□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 AST2YER101C 1293 nt3.06□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 LIN1YHR156C 1023 nt3.06□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 ALY1YKR021W 2748 nt3.06□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 RAX2YLR084C 3663 nt3.06□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 CEP3YMR168C 1827 nt3.06□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.06□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 snR189snR189 189 nt3.06□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YPR203WYPR203W 309 nt3.06□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 SPB1YCL054W 2526 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 DBP7YKR024C 2229 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 SSP1YHR184W 1716 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YCR090CYCR090C 549 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 GPM2YDL021W 936 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 RSM28YDR494W 1086 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YEA4YEL004W 1029 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YER107W-AYER107W-A 321 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 PEF1YGR058W 1008 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YGR115CYGR115C 780 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YHR213WYHR213W 597 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 RCN1YKL159C 636 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 MRP49YKL167C 414 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YAR062WYAR062W 597 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YML037CYML037C 1023 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YNL050CYNL050C 813 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YBR062CYBR062C 543 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 TAZ1YPR140W 1146 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 TFC4YGR047C 3078 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 ECM29YHL030W 5607 nt3.05□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 GEA1YJR031C 4227 nt3.04□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 NMD2YHR077C 3270 nt3.04□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 FUS1YCL027W 1539 nt3.04□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 SGS1YMR190C 4344 nt3.04□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 NTF2YER009W 378 nt3.04□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YAP5YIR018W 738 nt3.04□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YLR297WYLR297W 390 nt3.04□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 BRX1YOL077C 876 nt3.04□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 ARL3YPL051W 597 nt3.04□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 SUS1YBR111W-A 291 nt3.04□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 SSN2YDR443C 4263 nt3.04□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 TAO3YIL129C 7131 nt3.03□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 POM152YMR129W 4014 nt3.03□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YMR31YFR049W 372 nt3.03□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.03□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 NYV1YLR093C 762 nt3.03□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 CWC24YLR323C 780 nt3.03□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 NBP1YLR457C 960 nt3.03□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 IRC21YMR073C 606 nt3.03□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 YBR051WYBR051W 351 nt3.03□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 SHS1YDL225W 1656 nt3.03□□□□□ -1.92
RTP1Q12751 VPS41YDR080W 2979 nt3.03□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 APM3YBR288C 1452 nt3.03□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 YHR078WYHR078W 1659 nt3.02□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 PDR3YBL005W 2931 nt3.02□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 MRPL33YMR286W 261 nt3.02□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 BFR1YOR198C 1413 nt3.02□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 TCB2YNL087W 3537 nt3.01□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 YPL216WYPL216W 3309 nt3.01□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 NOP19YGR251W 591 nt3.01□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 CAP1YKL007W 807 nt3.01□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 SDH3YKL141W 597 nt3.01□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 SRL4YPL033C 846 nt3.01□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 POP7YBR167C 423 nt3.01□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 DRS2YAL026C 4068 nt3.01□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 BNR1YIL159W 4128 nt3.01□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 COG3YER157W 2406 nt3□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 DNL4YOR005C 2835 nt3□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 YDR203WYDR203W 318 nt3□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 PRE1YER012W 597 nt3□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 TAD1YGL243W 1203 nt3□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt3□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt3□□□□□ -1.93
RTP1Q12751 ASG7YJL170C 630 nt3□□□□□ -1.93
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