Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD47Q08722 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD47Q08722 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD47Q08722 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD47Q08722 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD47Q08722 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD47Q08722 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD47Q08722 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CD47Q08722 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms