Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms