Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS28P62857 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RPS28P62857 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RPS28P62857 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RPS28P62857 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RPS28P62857 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RPS28P62857 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
RPS28P62857 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
RPS28P62857 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS28P62857 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS28P62857 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS28P62857 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms