Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPEP62304 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms