Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDL3P58872 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDL3P58872 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms