Protein–RNA interactions for Protein: P58005

SESN3, Sestrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESN3P58005 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SESN3P58005 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SESN3P58005 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SESN3P58005 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SESN3P58005 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SESN3P58005 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SESN3P58005 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SESN3P58005 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SESN3P58005 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SESN3P58005 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SESN3P58005 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SESN3P58005 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SESN3P58005 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SESN3P58005 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SESN3P58005 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms