Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A9P48067 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms