Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB3P28472 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRB3P28472 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms