Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEX2P28328 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEX2P28328 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEX2P28328 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEX2P28328 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEX2P28328 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PEX2P28328 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PEX2P28328 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX2P28328 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX2P28328 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX2P28328 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX2P28328 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX2P28328 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX2P28328 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX2P28328 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX2P28328 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX2P28328 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX2P28328 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PEX2P28328 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PEX2P28328 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX2P28328 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX2P28328 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX2P28328 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX2P28328 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX2P28328 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX2P28328 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX2P28328 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX2P28328 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX2P28328 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX2P28328 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX2P28328 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX2P28328 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX2P28328 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX2P28328 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PEX2P28328 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PEX2P28328 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX2P28328 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX2P28328 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX2P28328 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PEX2P28328 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms