Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA1P25391 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LAMA1P25391 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms