Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTF3P20783 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NTF3P20783 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NTF3P20783 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NTF3P20783 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NTF3P20783 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NTF3P20783 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NTF3P20783 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NTF3P20783 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NTF3P20783 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NTF3P20783 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTF3P20783 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTF3P20783 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTF3P20783 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTF3P20783 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTF3P20783 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTF3P20783 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTF3P20783 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTF3P20783 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTF3P20783 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTF3P20783 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTF3P20783 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTF3P20783 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTF3P20783 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTF3P20783 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTF3P20783 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms