Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRT15P19012 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT15P19012 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT15P19012 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT15P19012 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT15P19012 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT15P19012 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT15P19012 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT15P19012 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT15P19012 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT15P19012 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT15P19012 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT15P19012 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT15P19012 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT15P19012 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT15P19012 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT15P19012 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT15P19012 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT15P19012 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms