Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms