Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG12O94817 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG12O94817 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG12O94817 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG12O94817 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG12O94817 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG12O94817 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG12O94817 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG12O94817 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG12O94817 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATG12O94817 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG12O94817 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG12O94817 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG12O94817 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG12O94817 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG12O94817 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG12O94817 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG12O94817 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG12O94817 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATG12O94817 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG12O94817 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG12O94817 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG12O94817 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG12O94817 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG12O94817 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG12O94817 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG12O94817 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG12O94817 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms