Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLIT2O94813 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLIT2O94813 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms