Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX3O75364 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX3O75364 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX3O75364 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX3O75364 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITX3O75364 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITX3O75364 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITX3O75364 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITX3O75364 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms