Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUBNO60494 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUBNO60494 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUBNO60494 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUBNO60494 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUBNO60494 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUBNO60494 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUBNO60494 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUBNO60494 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUBNO60494 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUBNO60494 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUBNO60494 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUBNO60494 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CUBNO60494 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUBNO60494 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUBNO60494 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUBNO60494 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUBNO60494 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUBNO60494 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CUBNO60494 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUBNO60494 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUBNO60494 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUBNO60494 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUBNO60494 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUBNO60494 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUBNO60494 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CUBNO60494 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUBNO60494 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUBNO60494 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUBNO60494 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUBNO60494 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUBNO60494 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUBNO60494 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUBNO60494 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUBNO60494 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUBNO60494 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUBNO60494 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUBNO60494 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUBNO60494 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms