Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP2O14595 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms