Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
H7C1H1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
H7C1H1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H7C1H1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H7C1H1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H7C1H1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
H7C1H1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H7C1H1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms