Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 508.8 ms