Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TISP43B9A030 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TISP43B9A030 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms