Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGB1P1B2RPK0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGB1P1B2RPK0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms