Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB19A4D1S5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB19A4D1S5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms