Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQF3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQF3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms