Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP12Q9Y561 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRP12Q9Y561 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms