Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX24Q9Y343 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms