Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBX2Q9Y2T7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBX2Q9Y2T7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms