Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF13BQ9Y275 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms