Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN42

ATP1B4, Protein ATP1B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B4Q9UN42 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
ATP1B4Q9UN42 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP1B4Q9UN42 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms