Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms