Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALD1Q9ULE6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALD1Q9ULE6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms