Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBE1Q9UJT0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms