Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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RRN3Q9NYV6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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RRN3Q9NYV6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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RRN3Q9NYV6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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RRN3Q9NYV6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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RRN3Q9NYV6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRN3Q9NYV6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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