Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP8A2Q9NTI2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP8A2Q9NTI2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP8A2Q9NTI2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP8A2Q9NTI2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP8A2Q9NTI2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8A2Q9NTI2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8A2Q9NTI2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8A2Q9NTI2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8A2Q9NTI2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8A2Q9NTI2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP8A2Q9NTI2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms