Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRTAC1Q9NQ79 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms