Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP1Q9BWH6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms