Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPOQ9BU64 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPOQ9BU64 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPOQ9BU64 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPOQ9BU64 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPOQ9BU64 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPOQ9BU64 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPOQ9BU64 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPOQ9BU64 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CENPOQ9BU64 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPOQ9BU64 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms