Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS4Q9BT78 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms