Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms