Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms