Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC38A2Q96QD8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms