Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms