Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRERF1Q96PN7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRERF1Q96PN7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRERF1Q96PN7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRERF1Q96PN7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRERF1Q96PN7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRERF1Q96PN7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms