Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGLYRP2Q96PD5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGLYRP2Q96PD5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms